Protein–RNA interactions for Protein: Q61312

Tfap2c, Transcription factor AP-2 gamma, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2cQ61312 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Tfap2cQ61312 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tfap2cQ61312 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Tfap2cQ61312 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tfap2cQ61312 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tfap2cQ61312 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Tfap2cQ61312 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tfap2cQ61312 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tfap2cQ61312 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tfap2cQ61312 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tfap2cQ61312 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tfap2cQ61312 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tfap2cQ61312 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tfap2cQ61312 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tfap2cQ61312 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tfap2cQ61312 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tfap2cQ61312 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tfap2cQ61312 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tfap2cQ61312 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tfap2cQ61312 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tfap2cQ61312 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tfap2cQ61312 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tfap2cQ61312 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tfap2cQ61312 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tfap2cQ61312 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tfap2cQ61312 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tfap2cQ61312 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Tfap2cQ61312 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tfap2cQ61312 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tfap2cQ61312 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tfap2cQ61312 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tfap2cQ61312 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tfap2cQ61312 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tfap2cQ61312 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tfap2cQ61312 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tfap2cQ61312 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tfap2cQ61312 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Tfap2cQ61312 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tfap2cQ61312 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tfap2cQ61312 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tfap2cQ61312 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tfap2cQ61312 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tfap2cQ61312 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tfap2cQ61312 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tfap2cQ61312 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tfap2cQ61312 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Tfap2cQ61312 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tfap2cQ61312 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tfap2cQ61312 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tfap2cQ61312 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tfap2cQ61312 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tfap2cQ61312 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfap2cQ61312 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tfap2cQ61312 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tfap2cQ61312 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tfap2cQ61312 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tfap2cQ61312 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tfap2cQ61312 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tfap2cQ61312 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tfap2cQ61312 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tfap2cQ61312 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tfap2cQ61312 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tfap2cQ61312 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tfap2cQ61312 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tfap2cQ61312 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tfap2cQ61312 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tfap2cQ61312 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tfap2cQ61312 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tfap2cQ61312 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tfap2cQ61312 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tfap2cQ61312 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tfap2cQ61312 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tfap2cQ61312 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Tfap2cQ61312 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tfap2cQ61312 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tfap2cQ61312 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tfap2cQ61312 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tfap2cQ61312 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tfap2cQ61312 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tfap2cQ61312 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tfap2cQ61312 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tfap2cQ61312 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tfap2cQ61312 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tfap2cQ61312 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tfap2cQ61312 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tfap2cQ61312 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tfap2cQ61312 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tfap2cQ61312 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tfap2cQ61312 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tfap2cQ61312 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tfap2cQ61312 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tfap2cQ61312 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tfap2cQ61312 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tfap2cQ61312 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tfap2cQ61312 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tfap2cQ61312 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tfap2cQ61312 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfap2cQ61312 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tfap2cQ61312 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tfap2cQ61312 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms