Protein–RNA interactions for Protein: B1AYH9

Gm13271, MCG146419, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13271B1AYH9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
Gm13271B1AYH9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Gm13271B1AYH9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Gm13271B1AYH9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Gm13271B1AYH9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gm13271B1AYH9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Gm13271B1AYH9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Gm13271B1AYH9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Gm13271B1AYH9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gm13271B1AYH9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gm13271B1AYH9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Gm13271B1AYH9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Gm13271B1AYH9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Gm13271B1AYH9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gm13271B1AYH9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gm13271B1AYH9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Gm13271B1AYH9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Gm13271B1AYH9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gm13271B1AYH9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gm13271B1AYH9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gm13271B1AYH9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Gm13271B1AYH9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gm13271B1AYH9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gm13271B1AYH9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Gm13271B1AYH9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gm13271B1AYH9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gm13271B1AYH9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gm13271B1AYH9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Gm13271B1AYH9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Gm13271B1AYH9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gm13271B1AYH9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gm13271B1AYH9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Gm13271B1AYH9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gm13271B1AYH9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gm13271B1AYH9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Gm13271B1AYH9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gm13271B1AYH9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gm13271B1AYH9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Gm13271B1AYH9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gm13271B1AYH9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gm13271B1AYH9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gm13271B1AYH9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gm13271B1AYH9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gm13271B1AYH9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gm13271B1AYH9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gm13271B1AYH9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gm13271B1AYH9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gm13271B1AYH9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Gm13271B1AYH9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gm13271B1AYH9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gm13271B1AYH9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gm13271B1AYH9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm13271B1AYH9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gm13271B1AYH9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gm13271B1AYH9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gm13271B1AYH9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gm13271B1AYH9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gm13271B1AYH9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm13271B1AYH9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gm13271B1AYH9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm13271B1AYH9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm13271B1AYH9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm13271B1AYH9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm13271B1AYH9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Gm13271B1AYH9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm13271B1AYH9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm13271B1AYH9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Gm13271B1AYH9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm13271B1AYH9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm13271B1AYH9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm13271B1AYH9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm13271B1AYH9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm13271B1AYH9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm13271B1AYH9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm13271B1AYH9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm13271B1AYH9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm13271B1AYH9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm13271B1AYH9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm13271B1AYH9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm13271B1AYH9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm13271B1AYH9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm13271B1AYH9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm13271B1AYH9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm13271B1AYH9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm13271B1AYH9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm13271B1AYH9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm13271B1AYH9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm13271B1AYH9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm13271B1AYH9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm13271B1AYH9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm13271B1AYH9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm13271B1AYH9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm13271B1AYH9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm13271B1AYH9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm13271B1AYH9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gm13271B1AYH9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm13271B1AYH9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm13271B1AYH9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm13271B1AYH9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm13271B1AYH9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms