Protein–RNA interactions for Protein: Q6P566

Lix1, Protein limb expression 1 homolog, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lix1Q6P566 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Lix1Q6P566 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lix1Q6P566 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lix1Q6P566 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Lix1Q6P566 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lix1Q6P566 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lix1Q6P566 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Lix1Q6P566 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lix1Q6P566 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Lix1Q6P566 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lix1Q6P566 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lix1Q6P566 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Lix1Q6P566 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lix1Q6P566 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lix1Q6P566 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lix1Q6P566 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lix1Q6P566 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Lix1Q6P566 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lix1Q6P566 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lix1Q6P566 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lix1Q6P566 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lix1Q6P566 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lix1Q6P566 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lix1Q6P566 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lix1Q6P566 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lix1Q6P566 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lix1Q6P566 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Lix1Q6P566 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lix1Q6P566 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lix1Q6P566 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lix1Q6P566 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lix1Q6P566 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lix1Q6P566 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lix1Q6P566 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Lix1Q6P566 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lix1Q6P566 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lix1Q6P566 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lix1Q6P566 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lix1Q6P566 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lix1Q6P566 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lix1Q6P566 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lix1Q6P566 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lix1Q6P566 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lix1Q6P566 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lix1Q6P566 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lix1Q6P566 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lix1Q6P566 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lix1Q6P566 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lix1Q6P566 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lix1Q6P566 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lix1Q6P566 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lix1Q6P566 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lix1Q6P566 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lix1Q6P566 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lix1Q6P566 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lix1Q6P566 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lix1Q6P566 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lix1Q6P566 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lix1Q6P566 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lix1Q6P566 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lix1Q6P566 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lix1Q6P566 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lix1Q6P566 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Lix1Q6P566 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lix1Q6P566 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lix1Q6P566 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lix1Q6P566 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lix1Q6P566 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lix1Q6P566 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lix1Q6P566 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lix1Q6P566 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lix1Q6P566 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lix1Q6P566 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lix1Q6P566 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lix1Q6P566 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lix1Q6P566 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lix1Q6P566 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lix1Q6P566 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lix1Q6P566 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lix1Q6P566 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lix1Q6P566 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lix1Q6P566 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lix1Q6P566 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Lix1Q6P566 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lix1Q6P566 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lix1Q6P566 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lix1Q6P566 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lix1Q6P566 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lix1Q6P566 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lix1Q6P566 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lix1Q6P566 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lix1Q6P566 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lix1Q6P566 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lix1Q6P566 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lix1Q6P566 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lix1Q6P566 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lix1Q6P566 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lix1Q6P566 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lix1Q6P566 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lix1Q6P566 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
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