Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
ComtO88587 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ComtO88587 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ComtO88587 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
ComtO88587 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ComtO88587 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
ComtO88587 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ComtO88587 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ComtO88587 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ComtO88587 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ComtO88587 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ComtO88587 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ComtO88587 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ComtO88587 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ComtO88587 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ComtO88587 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ComtO88587 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ComtO88587 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ComtO88587 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ComtO88587 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ComtO88587 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ComtO88587 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ComtO88587 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ComtO88587 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ComtO88587 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ComtO88587 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ComtO88587 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ComtO88587 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ComtO88587 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ComtO88587 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ComtO88587 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ComtO88587 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ComtO88587 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ComtO88587 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ComtO88587 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ComtO88587 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ComtO88587 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ComtO88587 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ComtO88587 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ComtO88587 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ComtO88587 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ComtO88587 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ComtO88587 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ComtO88587 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ComtO88587 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ComtO88587 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ComtO88587 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ComtO88587 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ComtO88587 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ComtO88587 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ComtO88587 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ComtO88587 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ComtO88587 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ComtO88587 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ComtO88587 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ComtO88587 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ComtO88587 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ComtO88587 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ComtO88587 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ComtO88587 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ComtO88587 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ComtO88587 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ComtO88587 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ComtO88587 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ComtO88587 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ComtO88587 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ComtO88587 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ComtO88587 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ComtO88587 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ComtO88587 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ComtO88587 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ComtO88587 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ComtO88587 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ComtO88587 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ComtO88587 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ComtO88587 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ComtO88587 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ComtO88587 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ComtO88587 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ComtO88587 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ComtO88587 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ComtO88587 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ComtO88587 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ComtO88587 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ComtO88587 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ComtO88587 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ComtO88587 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ComtO88587 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ComtO88587 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ComtO88587 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ComtO88587 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ComtO88587 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ComtO88587 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ComtO88587 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ComtO88587 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ComtO88587 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ComtO88587 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ComtO88587 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ComtO88587 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ComtO88587 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
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