RNA–Protein interactions for RNA: YOR014W

RTS1, Transcript of B-type regulatory subunit of protein phosphatase 2A (PP2A), yeast

Gene RTS1, Length 2,274 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTS1	YOR014W	YIG1	Q08956	461 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	YBR284W	P38150	797 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	RKM2	Q03942	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	CDC11	P32458	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	UME1	Q03010	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	NUP145	P49687	1317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	PRK1	P40494	810 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RTS1	YOR014W	HNT2	P49775	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	MLS1	P30952	554 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	ALG3	P38179	458 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTS1	YOR014W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	DSS1	P39112	969 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	RGD1	P38339	666 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	GUP1	P53154	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	GNT1	Q12096	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	VBA3	P25594	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	DOM34	P33309	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	PET10	P36139	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	OSH7	P38755	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	NIT1	P40447	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	NEO1	P40527	1151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	YNR063W	P53749	607 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	SRC1	Q03707	834 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	SLX4	Q12098	748 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	FUI1	P38196	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	SIT1	P39980	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	MGS1	P40151	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	SPO74	P45819	413 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	COG6	P53959	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	RAD53	P22216	821 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	MEC3	Q02574	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	SND1	Q04007	877 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	PTC5	Q12511	572 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	YBR071W	P38243	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	TGL2	P54857	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	CDC9	P04819	755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	KAR1	P11927	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	TRK1	P12685	1235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	DIT1	P21623	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	EUG1	P32474	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	BAP2	P38084	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	PNT1	P38969	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
RTS1	YOR014W	ALG2	P43636	503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	GSY1	P23337	708 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	GCV1	P48015	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	OPT2	Q06593	877 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	SRD1	P09007	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	AFR1	P33304	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	LEM3	P42838	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
RTS1	YOR014W	YER152C	P10356	443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	FPS1	P23900	669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	PCL2	P25693	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	MET13	P53128	600 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	ATP4	P05626	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	SPC29	P33419	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	ERT1	P38140	529 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	ATG14	P38270	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	YAR028W	P39548	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTS1	YOR014W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
RTS1	YOR014W	PIF1	P07271	859 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RTS1	YOR014W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
RTS1	YOR014W	PPH3	P32345	308 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RTS1	YOR014W	HIR1	P32479	840 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RTS1	YOR014W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64

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