RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	SAM35	P14693	329 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	PRO1	P32264	428 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	MDL2	P33311	773 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	VAC8	P39968	578 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	SPO20	Q04359	397 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	COQ4	O13525	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	ADP1	P25371	1049 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	PTC7	P38797	343 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	CTH1	P47976	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	TNA1	P53322	534 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	SSY1	Q03770	852 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	YER152C	P10356	443 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	INO1	P11986	533 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
YCT1	YLL055W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	GTS1	P40956	396 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	GNT1	Q12096	491 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	RKM4	Q12504	494 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YCT1	YLL055W	BAS1	P22035	811 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	CCZ1	P38273	704 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	RIP-Chip
YCT1	YLL055W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	OPI10	Q08202	246 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	SNF5	P18480	905 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	YKL107W	P34251	309 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	BAP2	P38084	609 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	SEA4	P38164	1038 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	RSC58	Q07979	502 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	PRI2	P20457	528 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	HSP78	P33416	811 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	PIK1	P39104	1066 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	YGL176C	P46945	554 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	ESC2	Q06340	456 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	AGP1	P25376	633 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	AIM26	P32858	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	ORC3	P54790	616 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	RSB1	Q08417	382 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
YCT1	YLL055W	YFL054C	P43549	646 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	YKL069W	P36088	180 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	MXR1	P40029	184 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
YCT1	YLL055W	SPS1	P08458	490 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	PNT1	P38969	423 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	VBA5	P36172	582 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	GEM1	P39722	662 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	SHE9	Q04172	456 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	ACM1	Q08981	209 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	DFG16	Q99234	619 aa		4.65	□□□□□ -1.66
YCT1	YLL055W	LRG1	P35688	1017 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	UGA2	P38067	497 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	MBP1	P39678	833 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	SLA2	P33338	968 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	MRP8	P35719	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	ECL1	P48235	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	ENV11	P53246	860 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	SVS1	Q12254	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	RFC5	P38251	354 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	PBY1	P38254	753 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	IRR1	P40541	1150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	ATG13	Q06628	738 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	BI4	P03879	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
YCT1	YLL055W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	STE5	P32917	917 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	SEG2	P34250	1132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	YBR184W	P38299	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	RRT14	P40470	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	AVT1	P47082	602 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YCT1	YLL055W	NNF1	P47149	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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