RNA–Protein interactions for RNA: YJR112W

NNF1, Transcript of Essential component of the MIND kinetochore complex, yeast

Gene NNF1, Length 606 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNF1	YJR112W	CAN1	P04817	590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	GAL11	P19659	1081 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	ARE1	P25628	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	NCE103	P53615	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	UBX5	Q06682	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	GNT1	Q12096	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	AI1	P03875	834 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	PHO8	P11491	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	NFS1	P25374	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	ALR2	P43553	858 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	YNR014W	P53719	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	GAS5	Q08193	484 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NNF1	YJR112W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	YER152C	P10356	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	TRK2	P28584	889 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	KIP1	P28742	1111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	MDJ1	P35191	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	GPT2	P36148	743 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	TAF8	Q03750	510 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	SPO21	Q12411	609 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	SFA1	P32771	386 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	NNK1	P36003	928 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	PNT1	P38969	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	GPB2	P39717	880 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	HUL4	P40985	892 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	RTA1	P53047	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	BUD9	P53226	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	BET3	P36149	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	YFL066C	P43538	392 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	THI4	P32318	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	MNN1	P39106	762 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	MXR1	P40029	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
NNF1	YJR112W	YJL045W	P47052	634 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	ALT1	P52893	592 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	IOC4	Q04213	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	THI72	Q08579	599 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	AI3	P03877	415 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	RSC6	P25632	483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	CCC2	P38995	1004 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
NNF1	YJR112W	TPP1	Q03796	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	TDA6	Q06466	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	TOP3	P13099	656 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	PRY1	P47032	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	EAR1	Q03212	550 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NNF1	YJR112W	MSH2	P25847	964 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	CDC11	P32458	415 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	YBR284W	P38150	797 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	YFL054C	P43549	646 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	TPO2	P53283	614 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	TNA1	P53322	534 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	GIC2	Q06648	383 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	SNF5	P18480	905 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	YSC84	P32793	468 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	SLA2	P33338	968 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	GEM1	P39722	662 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	YJR142W	P47173	342 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	MAL11	P53048	616 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	NSG2	P53898	299 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	ACM1	Q08981	209 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	SWR1	Q05471	1514 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NNF1	YJR112W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69

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