RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641582.1

CASC19-241, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,421 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-241ENST00000641582 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 CD163Q86VB7 1156 aa8.62□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 NBPF15Q8N660 670 aa8.62□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.62□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 TRIM52Q96A61 297 aa8.62□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 A0A1W2PRU2 124 aa8.61□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 MCM6Q14566 821 aa8.61□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.61□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.61□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 NR1H3Q13133 447 aa8.6□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 WDR44Q5JSH3 913 aa8.6□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.6□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.59□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 F11P03951 625 aa8.59□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 THBS1P07996 1170 aa8.59□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.59□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.59□□□□□ -1.03
CASC19-241ENST00000641582 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.58□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 CHRNA4P43681 627 aa8.57□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 IRF5Q13568 498 aa8.57□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.57□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.57□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.57□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.57□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 PIK3R2O00459 728 aa8.56□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 GNB5O14775 395 aa8.56□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 NLRP3Q96P20 1036 aa8.56□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.56□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 PHF24Q9UPV7 400 aa8.55□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 AMPD1P23109 780 aa8.54□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.54□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 CLN3Q13286 438 aa8.54□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 DOC2BQ14184 412 aa8.54□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.53□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 COG6Q9Y2V7 657 aa8.53□□□□□ -1.04
CASC19-241ENST00000641582 ABL2P42684 1182 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 ERVK-9P63128 1117 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 FLIIQ13045 1269 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 BTBD6Q96KE9 485 aa8.52□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 ZNF592Q92610 1267 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 GGA1Q9UJY5 639 aa8.51□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 C2CD2LO14523 706 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 DGKGP49619 791 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 GPAMQ9HCL2 828 aa8.5□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 EPXP11678 715 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 VAC14Q08AM6 782 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 POM121Q96HA1 1249 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.49□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 BMP4P12644 408 aa8.48□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 RNF20Q5VTR2 975 aa8.48□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.48□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 CCDC125Q86Z20 511 aa8.48□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.48□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.47□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 WASHC4Q2M389 1173 aa8.47□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 A0A1B0GTH6 734 aa8.46□□□□□ -1.05
CASC19-241ENST00000641582 GATA4P43694 442 aa8.46□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.46□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 BTBD11A6QL63 1104 aa8.45□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 CTBSQ01459 385 aa8.45□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.45□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.45□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 RAD21O60216 631 aa8.44□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 TRAK2O60296 914 aa8.44□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 FGFR3P22607 806 aa8.44□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 SCTRP47872 440 aa8.44□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 ARTNQ5T4W7 220 aa8.44□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 RNF135Q8IUD6 432 aa8.44□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.44□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 ARAFP10398 606 aa8.43□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 PHKA2P46019 1235 aa8.43□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.43□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.43□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 RUBCNLQ9H714 662 aa8.43□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.43□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.43□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 BNIP3LO60238 219 aa8.42□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.42□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 PGBD3Q8N328 593 aa8.42□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 SOX11P35716 441 aa8.41□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 CENPCQ03188 943 aa8.41□□□□□ -1.06
CASC19-241ENST00000641582 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.41□□□□□ -1.06
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