RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GTH6 734 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 AMPD1P23109 780 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF592Q92610 1267 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 TRAK2O60296 914 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 THBS1P07996 1170 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 CD163Q86VB7 1156 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 DDRGK1Q96HY6 314 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 SUV39H2Q9H5I1 410 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 GPAMQ9HCL2 828 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 GNRH1P01148 92 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 BMP4P12644 408 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 PGBD3Q8N328 593 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 BTBD6Q96KE9 485 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM34Q9BYJ4 488 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 OSBPL3Q9H4L5 887 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 SCTRP47872 440 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 CENPCQ03188 943 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 EFHC2Q5JST6 749 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 CNKSR1Q969H4 720 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 GGA1Q9UJY5 639 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 C2CD2LO14523 706 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO45P0C2W1 286 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 ARAFP10398 606 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 EPXP11678 715 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 FGFR3P22607 806 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 RFC5P40937 340 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 GNASQ5JWF2 1037 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 SEMA6BQ9H3T3 888 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRM-204ENST00000577468 ITGB7P26010 798 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 CHRNA4P43681 627 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 PHKA2P46019 1235 aa5.27□□□□□ -1.57
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PTPRM-204ENST00000577468 TMEM259Q4ZIN3 620 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 IL2RAP01589 272 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 MSX1P28360 303 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 CTBSQ01459 385 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.26□□□□□ -1.57
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PTPRM-204ENST00000577468 XAGE2Q96GT9 111 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 RUBCNLQ9H714 662 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 BNIP3LO60238 219 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 MYCP01106 439 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 NR1H3Q13133 447 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 DOC2BQ14184 412 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 C4orf17Q53FE4 359 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 FAM117AQ9C073 453 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 CRISPLD1Q9H336 500 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 KDM4CQ9H3R0 1056 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 NEURL1BA8MQ27 555 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 GATA4P43694 442 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 ESCO1Q5FWF5 840 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 ADH6P28332 368 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 CHSY3Q70JA7 882 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 RHBDD1Q8TEB9 315 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 ARXQ96QS3 562 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 NLRP8Q86W28 1048 aa5.22□□□□□ -1.57
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PTPRM-204ENST00000577468 C1orf216Q8TAB5 229 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRM-204ENST00000577468 FAM182BQ5T319 152 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 GOPCQ9HD26 462 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 PLVAPQ9BX97 442 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM11Q96F44 468 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRM-204ENST00000577468 KLF15Q9UIH9 416 aa5.19□□□□□ -1.58
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