RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	BTBD6	Q96KE9	485 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	GGA1	Q9UJY5	639 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GTH6	734 aa		6.58	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	BTBD11	A6QL63	1104 aa		6.57	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	C2CD2L	O14523	706 aa		6.57	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	BMP4	P12644	408 aa		6.57	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		6.57	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.57	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	GPAM	Q9HCL2	828 aa		6.57	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		6.56	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	GATA4	P43694	442 aa		6.56	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		6.56	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAK2	O60296	914 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	ARAF	P10398	606 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	FGFR3	P22607	806 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF135	Q8IUD6	432 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		6.55	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	AP1G2	O75843	785 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	ARTN	Q5T4W7	220 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF20	Q5VTR2	975 aa		6.54	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	SCTR	P47872	440 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	CTBS	Q01459	385 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	EFHC2	Q5JST6	749 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	PGBD3	Q8N328	593 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		6.53	□□□□□ -1.36
AKAP13-223	ENST00000560957	BNIP3L	O60238	219 aa		6.52	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	GNRH1	P01148	92 aa		6.52	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L8	P0C7I0	530 aa		6.52	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		6.52	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	CHSY3	Q70JA7	882 aa		6.52	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		6.52	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		6.52	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBBX	A8MT70	800 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	PHKA2	P46019	1235 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPC	Q03188	943 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	CNKSR1	Q969H4	720 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	RUBCNL	Q9H714	662 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		6.51	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	IL2RA	P01589	272 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	MSX1	P28360	303 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM11	Q96F44	468 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		6.5	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	DYRK3	O43781	588 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	C4orf17	Q53FE4	359 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		6.49	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO45	P0C2W1	286 aa		6.48	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	ADH6	P28332	368 aa		6.48	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		6.48	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		6.48	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		6.48	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	NBPF11	Q86T75	865 aa		6.47	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF592	Q92610	1267 aa		6.47	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	XAGE2	Q96GT9	111 aa		6.47	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	PLVAP	Q9BX97	442 aa		6.47	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM182B	Q5T319	152 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	KLF15	Q9UIH9	416 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		6.46	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		6.44	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		6.44	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRP8	Q86W28	1048 aa		6.44	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		6.44	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	LRP8	Q14114	963 aa		6.43	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	HCN2	Q9UL51	889 aa		6.42	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	APBA3	O96018	575 aa		6.41	□□□□□ -1.38

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