RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRQ-204ENST00000549355 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 ARAFP10398 606 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 PTK2Q05397 1052 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 PLVAPQ9BX97 442 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 KLF15Q9UIH9 416 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.11□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 BNIP3LO60238 219 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 CLN3Q13286 438 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 GPAMQ9HCL2 828 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 ABCC9O60706 1549 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 FGFR3P22607 806 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 HCN2Q9UL51 889 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRQ-204ENST00000549355 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 NR6A1Q15406 480 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 NLRP3Q96P20 1036 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 TXKP42681 527 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 ERVK-9P63128 1117 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A1B0GTH6 734 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 RUBCNLQ9H714 662 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRQ-204ENST00000549355 PAX4O43316 350 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 FZD5Q13467 585 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 BARGINQ6ZT62 677 aa9□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 HRH3Q9Y5N1 445 aa9□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 MSX1P28360 303 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 PHKA2P46019 1235 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 TRAK2O60296 914 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 ADH6P28332 368 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 MDFIQ99750 246 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRQ-204ENST00000549355 APBA3O96018 575 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 SCTRP47872 440 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 TRIM52Q96A61 297 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 CENPCQ03188 943 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 EFHC2Q5JST6 749 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM229AH3BQW9 127 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 IL2RAP01589 272 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM182BQ5T319 152 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 C4orf17Q53FE4 359 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 PGBD3Q8N328 593 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 ZMYND10O75800 440 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 ELNP15502 786 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 ADGRE1Q14246 886 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 GRIK4Q16099 956 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 CNKSR1Q969H4 720 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 RNF112Q9ULX5 631 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRQ-204ENST00000549355 NACC1Q96RE7 527 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 TNP2Q05952 138 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 LAMC2Q13753 1193 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 CCDC125Q86Z20 511 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 TRIM66O15016 1216 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 MBTPS1Q14703 1052 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRQ-204ENST00000549355 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms