RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP9B	O43861	1147 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TIMP2	P16035	220 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L5	A8MUK1	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	MYT1	Q01538	1121 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ITPKC	Q96DU7	683 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ERVK-9	P63128	1117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	SIRT1	Q96EB6	747 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PDE4D-222	ENST00000514552	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	LILRA1	O75019	489 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	USP4	Q13107	963 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	EML3	Q32P44	896 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	CYLD	Q9NQC7	956 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	RICTOR	Q6R327	1708 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	SCTR	P47872	440 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	NCOA4	Q13772	614 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552		Q6ZVU0	165 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	FANCA	O15360	1455 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	FMN1	Q68DA7	1419 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	HECW1	Q76N89	1606 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	NOD1	Q9Y239	953 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	PTPRM	P28827	1452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	AXIN1	O15169	862 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PDE4D-222	ENST00000514552	CBLB	Q13191	982 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	MEIOB	Q8N635	442 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	AKNA	Q7Z591	1439 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ADH1A	P07327	375 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TRIM50	Q86XT4	487 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RAPGEF3	O95398	923 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	AAAS	Q9NRG9	546 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	MADD	Q8WXG6	1647 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PLCH2	O75038	1416 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552		Q6ZNB5	142 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	RFX1	P22670	979 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ST8SIA5	O15466	376 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP1A2	P50993	1020 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	GTF2I	P78347	998 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	KIF14	Q15058	1648 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PDE4D-222	ENST00000514552	UPP2	O95045	317 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	GNRH1	P01148	92 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	PTGIR	P43119	386 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PDE4D-222	ENST00000514552	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64

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