RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 SLC24A1O60721 1099 aa6.78□□□□□ -1.32
ATXN3-211ENST00000511362 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
ATXN3-211ENST00000511362 MCTP1Q6DN14 999 aa6.78□□□□□ -1.32
ATXN3-211ENST00000511362 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.78□□□□□ -1.32
ATXN3-211ENST00000511362 RNF135Q8IUD6 432 aa6.78□□□□□ -1.32
ATXN3-211ENST00000511362 NLRP3Q96P20 1036 aa6.78□□□□□ -1.32
ATXN3-211ENST00000511362 ESPNB1AK53 854 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 CHSY3Q70JA7 882 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 TRIM11Q96F44 468 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 AK7Q96M32 723 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 PLVAPQ9BX97 442 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.77□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 CTBSQ01459 385 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.75□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 ARAFP10398 606 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 FGFR3P22607 806 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 TRIM52Q96A61 297 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.74□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 TXKP42681 527 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.73□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 PAX4O43316 350 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 CLN3Q13286 438 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 NR6A1Q15406 480 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.72□□□□□ -1.33
ATXN3-211ENST00000511362 BNIP3LO60238 219 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 PDE4DQ08499 809 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 BCANQ96GW7 911 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 RUBCNLQ9H714 662 aa6.71□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 A0A1B0GTH6 734 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 APBA3O96018 575 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 PGBD3Q8N328 593 aa6.7□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 PHKA2P46019 1235 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 EFHC2Q5JST6 749 aa6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 ADH6P28332 368 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 ERVK-9P63128 1117 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 KLF15Q9UIH9 416 aa6.67□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 MSX1P28360 303 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 FZD5Q13467 585 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-211ENST00000511362 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 FAM229AH3BQW9 127 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 NACC1Q96RE7 527 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 ELNP15502 786 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 CENPCQ03188 943 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 SCTRP47872 440 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 C4orf17Q53FE4 359 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 GNASQ5JWF2 1037 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 CNKSR1Q969H4 720 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.6□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 IL2RAP01589 272 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 GRIK4Q16099 956 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 PNMA1Q8ND90 353 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 HCN2Q9UL51 889 aa6.59□□□□□ -1.35
ATXN3-211ENST00000511362 TRAK2O60296 914 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 FAM182BQ5T319 152 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC125Q86Z20 511 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 CD33P20138 364 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
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