RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.49□□□□□ -1.05
PHC3-211ENST00000486042 A0A1B0GTH6 734 aa8.48□□□□□ -1.05
PHC3-211ENST00000486042 ZBBXA8MT70 800 aa8.48□□□□□ -1.05
PHC3-211ENST00000486042 TRAK2O60296 914 aa8.48□□□□□ -1.05
PHC3-211ENST00000486042 AMPD1P23109 780 aa8.48□□□□□ -1.05
PHC3-211ENST00000486042 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PHC3-211ENST00000486042 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.48□□□□□ -1.05
PHC3-211ENST00000486042 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PHC3-211ENST00000486042 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PHC3-211ENST00000486042 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PHC3-211ENST00000486042 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.47□□□□□ -1.05
PHC3-211ENST00000486042 BMP4P12644 408 aa8.46□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 BTBD6Q96KE9 485 aa8.46□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 GPAMQ9HCL2 828 aa8.46□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 GNRH1P01148 92 aa8.45□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.45□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 ITGB7P26010 798 aa8.45□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 PGBD3Q8N328 593 aa8.45□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 ZNF592Q92610 1267 aa8.45□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.45□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.45□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.45□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.45□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 GGA1Q9UJY5 639 aa8.45□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 C2CD2LO14523 706 aa8.44□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 SCTRP47872 440 aa8.44□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 CENPCQ03188 943 aa8.44□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 CNKSR1Q969H4 720 aa8.44□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.44□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 FBXO45P0C2W1 286 aa8.43□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 EPXP11678 715 aa8.43□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 CHRNA4P43681 627 aa8.43□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 DGKGP49619 791 aa8.43□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 EFHC2Q5JST6 749 aa8.43□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 ARAFP10398 606 aa8.42□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 FGFR3P22607 806 aa8.42□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.42□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.42□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 RFC5P40937 340 aa8.41□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 PHKA2P46019 1235 aa8.41□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 GNASQ5JWF2 1037 aa8.41□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.41□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.41□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.41□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 BNIP3LO60238 219 aa8.4□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 IL2RAP01589 272 aa8.4□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 CTBSQ01459 385 aa8.4□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 DOC2BQ14184 412 aa8.4□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 RNF135Q8IUD6 432 aa8.4□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.4□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 RUBCNLQ9H714 662 aa8.4□□□□□ -1.06
PHC3-211ENST00000486042 MSX1P28360 303 aa8.39□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 XAGE2Q96GT9 111 aa8.39□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.39□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 GATA4P43694 442 aa8.38□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.38□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.38□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 C4orf17Q53FE4 359 aa8.37□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.37□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 FAM117AQ9C073 453 aa8.37□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.36□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 NR1H3Q13133 447 aa8.36□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 CHSY3Q70JA7 882 aa8.36□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.36□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.35□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.34□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.34□□□□□ -1.07
PHC3-211ENST00000486042 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.33□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 ADH6P28332 368 aa8.33□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 FAM182BQ5T319 152 aa8.32□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 NLRP8Q86W28 1048 aa8.32□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.32□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.31□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.31□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 LCE3BQ5TA77 95 aa8.31□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.31□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 TRIM11Q96F44 468 aa8.3□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 PLVAPQ9BX97 442 aa8.3□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 ARTNQ5T4W7 220 aa8.29□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.29□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 GOPCQ9HD26 462 aa8.29□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.29□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 KLF15Q9UIH9 416 aa8.29□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.28□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PHC3-211ENST00000486042 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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