RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477216.1

SKIL-208, Transcript of SKI like proto-oncogene, human

TSL 4

Gene SKIL, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKIL-208	ENST00000477216	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
SKIL-208	ENST00000477216	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.52	■■■□□ 2.96
SKIL-208	ENST00000477216	C4B	P0C0L5	1744 aa		33.51	■■■□□ 2.96
SKIL-208	ENST00000477216	SSFA2	P28290	1259 aa		33.51	■■■□□ 2.95
SKIL-208	ENST00000477216	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.5	■■■□□ 2.95
SKIL-208	ENST00000477216	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SKIL-208	ENST00000477216	ANP32C	O43423	234 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SKIL-208	ENST00000477216	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
SKIL-208	ENST00000477216	CYP27B1	O15528	508 aa		33.45	■■■□□ 2.95
SKIL-208	ENST00000477216	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
SKIL-208	ENST00000477216	ITGB4	P16144	1822 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	PHF14	O94880	888 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.42	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	SIK1	P57059	783 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	PIGB	Q92521	554 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	NUDC	Q9Y266	331 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SKIL-208	ENST00000477216	KDR	P35968	1356 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SKIL-208	ENST00000477216	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SKIL-208	ENST00000477216	HMOX1	P09601	288 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SKIL-208	ENST00000477216	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SKIL-208	ENST00000477216	APLP1	P51693	650 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SKIL-208	ENST00000477216	GNPAT	O15228	680 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SKIL-208	ENST00000477216	TGFB2	P61812	414 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SKIL-208	ENST00000477216	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SKIL-208	ENST00000477216	ATP6V1A	P38606	617 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SKIL-208	ENST00000477216	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SKIL-208	ENST00000477216	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
SKIL-208	ENST00000477216	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
SKIL-208	ENST00000477216	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	33.3	■■■□□ 2.92
SKIL-208	ENST00000477216	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SKIL-208	ENST00000477216	KIF3C	O14782	793 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SKIL-208	ENST00000477216	ADRA2B	P18089	450 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SKIL-208	ENST00000477216	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SKIL-208	ENST00000477216	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SKIL-208	ENST00000477216	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
SKIL-208	ENST00000477216	TOMM70	O94826	608 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	MMP10	P09238	476 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	PHKG2	P15735	406 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	CCDC184	Q52MB2	194 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	FCHSD2	O94868	740 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	PRKAR2B	P31323	418 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	ITPK1	Q13572	414 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	BCS1L	Q9Y276	419 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SKIL-208	ENST00000477216	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	ATG3	Q9NT62	314 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	33.17	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	MRS2	Q9HD23	443 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	RFC4	P35249	363 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	SMIM5	Q71RC9	77 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SKIL-208	ENST00000477216	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216		A0A0G2JLW4	131 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216	RPS6KA4	O75676	772 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216	C4A	P0C0L4	1744 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SKIL-208	ENST00000477216	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SKIL-208	ENST00000477216	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SKIL-208	ENST00000477216	NEFM	P07197	916 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SKIL-208	ENST00000477216	GYS1	P13807	737 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SKIL-208	ENST00000477216	DPEP1	P16444	411 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SKIL-208	ENST00000477216	FSTL1	Q12841	308 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SKIL-208	ENST00000477216	PIM2	Q9P1W9	311 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SKIL-208	ENST00000477216	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SKIL-208	ENST00000477216	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SKIL-208	ENST00000477216	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SKIL-208	ENST00000477216	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms