RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa5.99□□□□□ -1.45
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SHQ1-204ENST00000468347 WASLO00401 505 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 BNIP3LO60238 219 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 RAB15P59190 212 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 FCHSD1Q86WN1 690 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 CFAP44Q96MT7 982 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 KLF15Q9UIH9 416 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PRU2 124 aa5.97□□□□□ -1.45
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SHQ1-204ENST00000468347 TBC1D2Q9BYX2 928 aa5.87□□□□□ -1.47
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SHQ1-204ENST00000468347 ELOA3Q8NG57 546 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-204ENST00000468347 PRDM6Q9NQX0 595 aa5.85□□□□□ -1.47
SHQ1-204ENST00000468347 PTK2Q05397 1052 aa5.84□□□□□ -1.47
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SHQ1-204ENST00000468347 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.84□□□□□ -1.47
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SHQ1-204ENST00000468347 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa5.84□□□□□ -1.47
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SHQ1-204ENST00000468347 M0R082 166 aa5.83□□□□□ -1.48
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SHQ1-204ENST00000468347 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
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SHQ1-204ENST00000468347 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SHQ1-204ENST00000468347 GPSM3Q9Y4H4 160 aa5.82□□□□□ -1.48
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SHQ1-204ENST00000468347 CD33P20138 364 aa5.81□□□□□ -1.48
SHQ1-204ENST00000468347 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.81□□□□□ -1.48
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SHQ1-204ENST00000468347 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SHQ1-204ENST00000468347 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SHQ1-204ENST00000468347 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.8□□□□□ -1.48
SHQ1-204ENST00000468347 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SHQ1-204ENST00000468347 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SHQ1-204ENST00000468347 ERVK-9P63128 1117 aa5.79□□□□□ -1.48
SHQ1-204ENST00000468347 QPCTQ16769 361 aa5.79□□□□□ -1.48
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