RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000170502.1

Becn1-216, Transcript of Beclin-1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Becn1, Length 725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn1-216ENSMUST00000170502 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa29■■■□□ 2,23
Becn1-216ENSMUST00000170502 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP29■■■□□ 2,23
Becn1-216ENSMUST00000170502 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa29■■■□□ 2,23
Becn1-216ENSMUST00000170502 Lrp5Q91VN0 1614 aa28,99■■■□□ 2,23
Becn1-216ENSMUST00000170502 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa28,99■■■□□ 2,23
Becn1-216ENSMUST00000170502 Usp21Q9QZL6 566 aa28,99■■■□□ 2,23
Becn1-216ENSMUST00000170502 Col11a2Q64739 1736 aa28,99■■■□□ 2,23
Becn1-216ENSMUST00000170502 Plch1Q4KWH5 1682 aa28,97■■■□□ 2,23
Becn1-216ENSMUST00000170502 Wdr66E9Q743 1299 aa28,97■■■□□ 2,23
Becn1-216ENSMUST00000170502 Zcwpw1Q6IR42 630 aa28,97■■■□□ 2,23
Becn1-216ENSMUST00000170502 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP28,97■■■□□ 2,23
Becn1-216ENSMUST00000170502 Lrrc43Q3V0L5 667 aa28,95■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Zfyve9A2A8R0 1397 aa28,95■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Adcy9P51830 1353 aa28,95■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Nav1Q8CH77 1875 aa28,94■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Q4VA45 678 aa28,94■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Q7TT23 1179 aa28,94■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP28,94■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28,93■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Rnf180Q3U827 592 aa28,91■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Ppef1O35655 650 aa28,9■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Btbd11Q6GQW0 1109 aa28,9■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa28,9■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 CpzQ8R4V4 654 aa28,89■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Sgip1Q8VD37 806 aa28,89■■■□□ 2,22
Becn1-216ENSMUST00000170502 Amhr2Q8K592 568 aa28,88■■■□□ 2,21
Becn1-216ENSMUST00000170502 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP28,88■■■□□ 2,21
Becn1-216ENSMUST00000170502 Kcnn1Q9EQR3 537 aa28,87■■■□□ 2,21
Becn1-216ENSMUST00000170502 Syde2E9PUP1 1314 aa28,86■■■□□ 2,21
Becn1-216ENSMUST00000170502 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP28,86■■■□□ 2,21
Becn1-216ENSMUST00000170502 Myo5bP21271 1818 aa28,85■■■□□ 2,21
Becn1-216ENSMUST00000170502 Apaf1O88879 1249 aa28,85■■■□□ 2,21
Becn1-216ENSMUST00000170502 PigbQ9JJQ0 542 aa28,85■■■□□ 2,21
Becn1-216ENSMUST00000170502 Tlr8P58682 1032 aa28,84■■■□□ 2,21
Becn1-216ENSMUST00000170502 Clcn1Q64347 994 aa28,84■■■□□ 2,21
Becn1-216ENSMUST00000170502 Mylk2Q8VCR8 613 aa28,82■■■□□ 2,2
Becn1-216ENSMUST00000170502 1810065E05RikQ5NC41 235 aa28,81■■■□□ 2,2
Becn1-216ENSMUST00000170502 MetP16056 1379 aa28,8■■■□□ 2,2
Becn1-216ENSMUST00000170502 Atf7ipQ7TT18 1306 aa28,8■■■□□ 2,2
Becn1-216ENSMUST00000170502 Slfnl1Q8BHW9 410 aa28,8■■■□□ 2,2
Becn1-216ENSMUST00000170502 Zbtb1Q91VL9 713 aa28,8■■■□□ 2,2
Becn1-216ENSMUST00000170502 Atp1b3P97370 278 aa28,79■■■□□ 2,2
Becn1-216ENSMUST00000170502 Irx6Q9ER75 438 aa28,79■■■□□ 2,2
Becn1-216ENSMUST00000170502 Tgfb2P27090 414 aa28,78■■■□□ 2,2
Becn1-216ENSMUST00000170502 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP28,78■■■□□ 2,2
Becn1-216ENSMUST00000170502 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP28,77■■■□□ 2,2
Becn1-216ENSMUST00000170502 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP28,76■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa28,76■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Usp19Q3UJD6 1360 aa28,75■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Gpr162Q3UN16 588 aa28,75■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Flad1Q8R123 492 aa28,75■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 TefQ9JLC6 301 aa28,75■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Wdhd1P59328 1117 aa28,74■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Cnnm1Q0GA42 951 aa28,74■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Cers3Q1A3B0 383 aa28,74■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Gm12185Q5NCB2 835 aa28,74■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa28,74■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Prim1P20664 417 aa28,73■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Cyp2c67Q569X9 491 aa28,73■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Ggnbp2Q5SV77 696 aa28,73■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP28,73■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP28,73■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Znf541Q0GGX2 1363 aa28,73■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Cavin4A2AMM0 362 aa28,72■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Cfap70D3YVL2 1141 aa28,72■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Camkk2Q8C078 588 aa28,72■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa28,71■■■□□ 2,19
Becn1-216ENSMUST00000170502 Exoc6Q8R313 802 aa28,7■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Golga2Q921M4 999 aa28,7■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Taf1dQ9D4V4 322 aa28,7■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Trip6Q9Z1Y4 480 aa28,7■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Iqsec3Q3TES0 1195 aa28,69■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 SnrkQ8VDU5 748 aa28,68■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Swt1Q9DBQ9 907 aa28,68■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 StrcQ8VIM6 1809 aa28,67■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Cyp2c69E9PXC3 491 aa28,67■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Cyp2c40P56657 491 aa28,67■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Strn4P58404 760 aa28,67■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Ubn2Q80WC1 1314 aa28,67■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Prr29B1ARI9 187 aa28,66■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP28,66■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP28,66■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Dpf1Q9QX66 387 aa28,66■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Col1a2Q01149 1372 aa28,64■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Prr5lA2AVJ5 370 aa28,64■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Prkab2Q6PAM0 271 aa28,64■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Tktl2Q9D4D4 627 aa28,64■■■□□ 2,18
Becn1-216ENSMUST00000170502 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP28,61■■■□□ 2,17
Becn1-216ENSMUST00000170502 Yy1Q00899 414 aa28,61■■■□□ 2,17
Becn1-216ENSMUST00000170502 ArsiQ32KI9 573 aa28,6■■■□□ 2,17
Becn1-216ENSMUST00000170502 Col4a1P02463 1669 aa28,6■■■□□ 2,17
Becn1-216ENSMUST00000170502 Ddx60E9PZQ1 1711 aa28,6■■■□□ 2,17
Becn1-216ENSMUST00000170502 Zscan21Q07231 555 aa28,59■■■□□ 2,17
Becn1-216ENSMUST00000170502 Dusp27Q148W8 1138 aa28,59■■■□□ 2,17
Becn1-216ENSMUST00000170502 FktnQ8R507 461 aa28,59■■■□□ 2,17
Becn1-216ENSMUST00000170502 Casz1Q9CWL2 1761 aa28,59■■■□□ 2,17
Becn1-216ENSMUST00000170502 Prdm11A2AGX3 565 aa28,58■■■□□ 2,17
Becn1-216ENSMUST00000170502 Tnnt1O88346 262 aa28,58■■■□□ 2,17
Becn1-216ENSMUST00000170502 Slurp2P0DP59 97 aa28,58■■■□□ 2,17
Becn1-216ENSMUST00000170502 CastP51125 788 aa28,58■■■□□ 2,17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12,1 ms