Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U3KPZ7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U3KPZ7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KPZ7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KPZ7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KPZ7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KPZ7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KPZ7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KPZ7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KPZ7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KPZ7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KPZ7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KPZ7 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KPZ7 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KPZ7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KPZ7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms