Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A3GALT2U3KPV4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A3GALT2U3KPV4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms