Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms