Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUBP2Q9Y5Y2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms