Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNPO3Q9Y5L0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNPO3Q9Y5L0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms