Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms