Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP20Q9Y2K6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP20Q9Y2K6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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