Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms