Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms