Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZRN3Q9UPQ7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms