Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM35Q9UPQ4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM35Q9UPQ4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms