Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZMYND8Q9ULU4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZMYND8Q9ULU4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms