Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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RABGEF1Q9UJ41 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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RABGEF1Q9UJ41 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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RABGEF1Q9UJ41 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RABGEF1Q9UJ41 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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RABGEF1Q9UJ41 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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RABGEF1Q9UJ41 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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RABGEF1Q9UJ41 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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RABGEF1Q9UJ41 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGEF1Q9UJ41 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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