Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms