Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL9Q9P2J3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms