Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHRF1Q9P1Y6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHRF1Q9P1Y6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms