Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRD1Q9P1U0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRD1Q9P1U0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms