Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms