Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
BICRAQ9NZM4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms