Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC4Q9NTJ3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC4Q9NTJ3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms