Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A2Q9NTI2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A2Q9NTI2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms