Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SALL1Q9NSC2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms