Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms