Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms