Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM10Q9NQV6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM10Q9NQV6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms