Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms