Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPM3Q9HCF6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPM3Q9HCF6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPM3Q9HCF6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPM3Q9HCF6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPM3Q9HCF6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPM3Q9HCF6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPM3Q9HCF6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPM3Q9HCF6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPM3Q9HCF6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPM3Q9HCF6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPM3Q9HCF6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPM3Q9HCF6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms