Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPJQ9HC77 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms