Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSPNQ9HAW4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms