Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCAF1Q9H7N4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms