Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1DQ9H5J8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms