Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NYXQ9GZU5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms