Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR12Q9C0I1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR12Q9C0I1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms